På Linköpings slott finns det gott om hemligheter. De äldsta delarna är från 1100-talet och slottet kan betraktas som landets äldsta profana byggnad. Under fyra sekel hade de katolska biskoparna, som till exempel biskop Brask, sitt säte i Linköping. Biskopsgården byggdes under dessa fyra sekel ut och till i olika etapper.
Under 1400-talet byggdes en ringmur som försvar runt gården. När Gustav Vasa tog makten i Sverige och inledde reformationen blev det slutet för de katolska biskoparna på Linköpings slott. År 1600 lät Vasas son hertig Karl fängsla Sveriges regering på slottet och, efter en summarisk rättegång, halshugga fem personer (Linköpings blodbad). Under Hemliga rum går resan till 1100-talet genom brunnsrummet, borgstugan och delar av biskopens trädgård.